La Universidad de Oxford se ha asociado con Oracle para identificar variantes de COVID-19

La Universidad de Oxford eligió a Oracle para acelerar la identificación de variantes de COVID-19.

Una plataforma especializada desarrollada en Oracle Cloud Infrastructure admite la secuenciación y las pruebas genómicas globales, mitigando así los efectos de cepas potencialmente peligrosas.

Según la Universidad de Oxford, la aparición de más variantes infecciosas del virus COVID-19 amenaza con retrasar la recuperación global e interferir con la inmunidad de la vacuna actual. Para ayudar al gobierno a identificar y abordar estas variantes con mayor rapidez, la universidad y Oracle combinaron las capacidades de la plataforma escalable de canalización de patógenos (SP3) de Oxford y Oracle Cloud Infrastructure (OCI) para crear un sistema global de análisis de patógenos. (GPAS) ha sido creado. Esta iniciativa se basa en las actividades de un consorcio financiado por un fideicomiso de bienvenida, que incluye a la Salud Pública de Gales, la Universidad de Cardiff y la Salud Pública de Inglaterra.

Derrick Crook, profesor de microbiología en la Facultad de Medicina de la Universidad de Oxford, Nafield, dijo: “Esta nueva y poderosa herramienta ayudará aún más a los científicos de salud pública en institutos de investigación, instituciones de salud pública, servicios médicos y compañías de diagnóstico en todo el mundo. Comprender las enfermedades infecciosas a partir del coronavirus.

“El Sistema Global de Análisis de Patógenos ayudará a establecer un estándar común global para ensamblar y analizar este nuevo virus y otras amenazas microbianas para la salud pública. Esto se sumará a la capacidad de procesar datos de patógenos. Añade dimensión. Nos complace asociarnos con Oracle para avanzar en nuestra investigación utilizando esta plataforma tecnológica de vanguardia. “

SP3, utilizado por primera vez para la tuberculosis, se reutiliza para integrar, estandarizar, analizar y comparar datos de secuencias de SARS-CoV-2, produciendo secuencias genómicas anotadas y mutaciones de interés como nuevas variantes. He identificado mi cuerpo. Las capacidades de procesamiento de SP3 han sido mejoradas por una amplia gama de nuevos trabajos de desarrollo por parte de Oracle para ofrecer alto rendimiento y seguridad, además de la disponibilidad global 7×24 de los sistemas SP3 en Oracle Cloud. A los pocos minutos de ser enviado a escala internacional, el sistema SP3 proporcionará resultados completos y estandarizados para el análisis de COVID-19. Se espera que los resultados se compartan con países de todo el mundo en un entorno seguro.

Sir John Bell, profesor de Regius Medicine en la Universidad de Oxford, dijo: Este programa asociado con Oracle nos acerca un paso más a este objetivo. “

En combinación con las capacidades de aprendizaje automático de Oracle Cloud, los científicos, investigadores y gobiernos colaboradores de todo el mundo podrán procesar, analizar, visualizar y manipular una amplia colección de datos de patógenos de COVID-19 por primera vez.

Esto incluye identificar los mutantes de interés y su impacto potencial en las vacunas y los efectos terapéuticos. Por ejemplo, el tablero analítico del sistema muestra qué cepas particulares se están propagando más rápido que otras y si las características genéticas contribuyen a aumentar la infectividad y evitar la vacunación. Oxford ya procesa más de la mitad de las secuencias de SARS-CoV-2 del mundo, para un total de más de 500.000.

etiqueta: nube, COVID-19 (nueva infección por coronavirus), ORacle, Universidad de Oxford

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